Discussion:Cycle de Krebs

              --41.202.219.76 (discuter) 19 septembre 2016 à 13:39 (CEST)GENERALITES 
      Le cycle de Krebs est la voie finale du métabolisme des limites, des glucides, et des protéines. C'est un ensemble de decarboxylation et de deshydrogenation de l'acide puryvite  dans la matrice mitochondriale . 

Retrait d'image

cycle de krebs simplifié

J'ai retiré cette image, ce n'est pas le cycle de krebs (?) --Baptiste Deleplace 30 octobre 2006 à 08:12 (CET)

En effet, c'est un mécanisme de plante C4 ! - Dakdada (discuter) 24 mai 2006 à 09:39 (CEST)

Erreur sur les fichiers "png"

Je ne sais pas comment modifier ce genre de fichier mais certaines ont des coquilles, notament les deux dernieres où visiblement il manque un atome H au dernier C du Malate...

ATP

Bonjour, j'aimerais savoir combien d'ATP est produite. Car c'est écrit dans le bilan, qu'une mole d'ATP est produite, et en dessous c'est écrit 1 ATP. Où est l'erreur?

C'est moi qui me suit trompé. En fait c'est écrit qu'il y a production de 2 ATP. Et donc, y-a-t-il une erreur dans l'article ? (Sinon tu as été assez clair.)

Salut!

Il n'y a pas d'erreur ;) Quand tu prends au départ une mole de glucose, le cycle de Krebs produit une mole d'ATP. Maintenant si tu ne mets au départ qu'une molécule de glucose, un seul ATP est produit. Cependant, comme travailler à l'échelle d'une molécule ne représent pas grand chose, on s'exprime plus logiquement en moles. Les données du tableau peuvent être interprétées comme des rapports (par exemple : il y aura 4 fois plus de molécules de CO₂ produites que de molécules de glucose engagées,...)

J'espère que j'ai été assez clair ;)

chtit_dracodiscut 28 octobre 2006 à 18:57 (CEST)

Ok je n'avais pas vu ça... Bon j'ai été voir dans mon cours de bio le truc correct. En fait, 1 glucose se glycolyse en 2 acides pyruviques (pyruvates), qui sont transformés en 2 acétylCoA, la base du cycle de Krebs. Donc, comme pour 1 acide pyruvique 1ATP est libéré durant le cycle de Krebs, pour 1 glucose, 2ATP sont libérés... Voilà pour le cycle de Krebs!

Mais bon, il y a quand même des problèmes car la glycolyse d'1 glucose libère également 2ATP. De même, le cycle de Krebs d'1 acétylCoA ne libère que 3NADH (ce qui fait 6 pour 1glucose). Mais 1 autre NADH (2pour 1 glucose) est aussi libéré dans la formation d'acétylCoA, à partir du pyruvate! 2 autres sont de plus formés lors de la glycolyse d'1 glucose en 2acides pyruviques... Ce qui nous donne 10NADH quand on va de 1 glucose jusqu'à la fin du cycle de Krebs...Or au niveau des ATP ceux de la glycolyse ne sont pas pris en compte...Bref c'est le bordel dans le bilan sur l'article il me semble...

En résumé, pour le cycle de Krebs à partir d'un acétylCoA sont produits : 2CO₂ + 1ATP + 3NADH (+3H⁺) + FADH₂. Pour avoir le tout à partir d'une mole de glucose, multiplie le tout par 2 mais note bien que l'on ne prend pas en compte les produits (ATP, NADH) de la glycolyse et de la formation d'acéthylCoA (qui se déroulent avant le cycle de Krebs) ;) chtit_dracodiscut 31 octobre 2006 à 16:36 (CET)

Merci !

Commentaire copié depuis l´article

Copié du paragraphe Bilan du cycle de Krebs par Nicolas Ray 5 mai 2007 à 10:01 (CEST)

En faite 36 ATP , car les 2 NADH2 produit lors de la glycolyse lors du passage dans le stroma de la mitochondrie ne pourront donner que 2FADH2 , d'où que 4 ATP et non 6 ATP. Donc Bilan energétique de 36 ATP et non 38!

ATP produit

Ce ne serait pas plutôt 32 ATP fournit par molécule de glucose? 4 directement . 25 grâce au NADH,H+ et 3 grâce au FADH2

Erreurs sur la chimie

Attention, de nombreuses erreurs dans les noms de molécules, dans une formule développée, dans l'écriture de mécanisme. Seul problème, beaucoup des erreurs sont incrustées dans les images et je me vois mal les modifier moi-même. Voici ce que j'ai pu remarquer :

• Presque toutes les formules des intermédiaires du cycle sont légèrement incorrectes. Exemple : la formule donnée dans le développement pour le citrate est celle de l'acide citrique. Il en va de même pour tous les intermédiaires en -ate. Je pense qu'il faudrait en fait changer les acides carboxyliques en carboxylates, tout comme dans l'image de l'introduction et alors les noms seraient corrects.
• La formule du malate/acide malique est un peu erronée : il y a un carbone trivalent car il manque un hydrogène
• Pourquoi écrire OH₂ dans le 2e schéma du cycle de Krebs, et non H₂O ?
• les flèches bleues dans la synthèse du citrate ne me plaisent pas. Il faudrait simplement réorienter 2 des 4 flèches : de sCoA vers le H de H2O et du O de C=O vers le H de CH3. Ca correspondrait plus alors à un déplacement d'électron.

--Nickele (d) 21 juin 2008 à 15:35 (CEST)

La convention d'utiliser la forme acide n'est pas trop surprenante, elle est rencontrée dans quelques livres. Au lecteur de connaître les conditions de pH dans lesquelles se passent les réactions. Les hydrogènes sont souvent omis des représentations, pour ne pas alourdir inutilement. OH2 est une écriture parfois rencontrée en biochimie. Je suis d'accord avec les flèches bleues, elles ne correspondent pas toutes à des mouvements d'électrons et devraient être corrigées. Moez ^m'écrire 21 juin 2008 à 16:00 (CEST)

Il est vrai que j'interviens dans un objectif purement de chimiste et que ce que j'observe, c'est que les noms ne correspondent pas aux molécules dessinées. Après, certains livres de biochimie le font peut être, mais je ne pense pas que ce soit une bonne chose... Je pense que la biochimie se doit de respecter les règles de nomenclature, surtout dans une encyclopédie qui doit faire le lien entre les matières. Ou au minimum d'évoquer le fait que les noms utilisés ne sont pas vraiment corrects. Après, il serait utile d'ajouter les liens comme acide malique, etc... dans le texte.--Nickele (d) 21 juin 2008 à 16:12 (CEST)

Je suis d'accord, je vais tacher de libérer un peu de temps pour cet article. Moez ^m'écrire 21 juin 2008 à 16:58 (CEST)

Vu qu'aucune modification n'a été apporté depuis quelques mois je me permets d'apporter les modifications demandées pour un meilleur respect des conventions --Angely (d) 30 octobre 2008 à 14:09 (CET)

Je pense qu'il faudrait fusionner les informations présentes sur les deux représentation du cycle pour ne faire figurer plus qu'un seul schéma, je laisse aux vrais biologistes le soin s'occuper de cette modification--Angely (d) 30 octobre 2008 à 15:07 (CET)

Fautes de frappe

Quelques accents (acétate, dépend) oubliés ont été ajoutés.

--Angely (d) 30 octobre 2008 à 12:12 (CET)

FADH₂ ou CoQH₂ ?

Bonjour, il faudrait se mettre d'accord si c'est le FAD ou le CoQ qui prend des électrons au Succinate!

--Papy.rabbit.08 5 janvier 2010 à 14:10 (CET)

Bilan energétique

Bonsoir, au niveau du bilan énergétique en aérobiose, le bilan ne devrait il pas être de de 30 à 32 ATP (en fonction de l'activation ou non des navettes glycerol phosphate et malate aspartate lors de la glycolyse) ?

• 1 glucose donne 2 pyruvates + 2 ATP + 2 NADH (=2 + 2*2.5 ATP)
• -> 2 pyruvates donnent 2 acétyl-CoA + 2 NADH (=5 ATP)
• -> 2 acetyl- CoA donnent 2* [3 NADH + 1 FADH2 + 1 GTP] (= 2* [3*2.5 + 1*1.5 + 1] ATP)

Et au final 7 + 5 + 20 = 32 ATP

Erreurs d'équations bilan

Certains essaient d'indiquer les erreurs dans le texte, je pense qu'il est préférable de modifier les 2 images ci-dessous qui donnent des équations non équilibrées (ça se voit rien qu'avec les charges) :

Serait-ce un H⁺ qui manque à gauche dans la première équation ? Et dans la 2e, peut-on écrire NADH²⁺ (base conjuguée de la NAD⁺) ? Et tant qu'à faire, les charges - des carboxylates seraient mieux placées en exposant (vaut mieux avoir le fichier original pour modifier).--Nickele (d) 1 mai 2011 à 16:56 (CEST)

Oxalosuccinate / acide oxalosuccinique.

Sur la page de l'isocitrate, il est indiqué que l'isocitrate se transforme en acide oxalosuccinique, et non en oxalosuccinate (comme c'est indiqué sur cette page). Qu'en est-il ? Wikini (discuter) 28 janvier 2015 à 17:49 (CET)

Erreur dans le graphique

Le schéma utilisé dans l'article comporte une erreur importante. La première étape du cycle est irréversible contrairement à ce que montre le schéma. --Moon rabbit 365 (discuter) 1 janvier 2017 à 19:37 (CET)

Quelques problèmes dans les réactions

Bonjour,

Durant la réaction oxaloacétate -> citrate, il y a un H qui a disparu... où est-il? J'ai cherché sans trouver

Ensuite, sur l'image en début il y a une faute également avec un carbone ayant 5 liaisons (sur le cis-aconitate)

Cordialement