Nomenclature des gènes de levure
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Le nom des gènes de levure contient 3 lettres et jusqu’à 3 chiffres : RHO1, RAD21… Le choix de ces 3 lettres est souvent lié à la fonction du gène.
Choix des lettres[modifier | modifier le code]
Gène sauvage[modifier | modifier le code]
Le gène sauvage est écrit en majuscule et en italique : RHO1, RAD21.
Gène à mutation récessive[modifier | modifier le code]
Les gènes portant une mutation récessive sont écrits en minuscule et en italique : rho1, rad21.
Allèles mutants[modifier | modifier le code]
Les allèles mutants sont représentés par un tiret et un nombre : rho1-23, rad21-456.
Protéine[modifier | modifier le code]
Le produit d’un gène (la protéine) est écrit avec une lettre majuscule suivie de deux minuscules sans italique. Un p est souvent ajouté à la fin : Rho1p, Rad21p
Autres[modifier | modifier le code]
Enfin, de nombreux gènes identifiés lors du séquençage du génome restent sans fonction connue. Ils sont nommés YDR518C, YML016W..., avec:
- Y pour yeast
- La deuxième lettre désigne le chromosome (D=IV, M=XIII....)
- L ou R désigne le bras droit (Right) ou gauche (Left) du chromosome.
- Les trois chiffres correspondent au n° du cadre de lecture ouvert (ORF) compté à partir du centromère.
- C et W indiquent si l’ORF est transcrite sur le brin Crick ou Watson
Notes et références[modifier | modifier le code]
Liens externes[modifier | modifier le code]
