Projet:Les Mille Pages/Cathy H. Wu

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Cathy H. Wu
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Cathy H. Wu est titulaire de la chaire Edward G. Jefferson et professeure et directrice du Center for Bioinformatics & Computational Biology (CBCB) à l'université du Delaware. Elle est également directrice de la Protein Information Resource (PIR) et du North east Bioinformatics Collaborative Steering Committee, et professeure adjointe au Georgetown University Medical Center[1].

Enfance et éducation[modifier | modifier le code]

Cathy Wu est l'enfant du milieu parmi les cinq filles et le fils de sa famille. Elle a répondu avec les meilleures notes à l'université nationale de Taiwan et a montré un flair pour la science, la logique et les calculs. Son père était ingénieur en aéronautique[2]. Elle obtient une licence en phytopathologie à l'université nationale de Taïwan en 1978, une maîtrise en phytopathologie à l'université Purdue en 1982, puis un doctorat dans la même université en 1984. Elle obtient ensuite un post-doc en biologie moléculaire à l'université d'État du Michigan en 1986 et un MS en informatique à l'[[université du Texas à Austin|université du Texas]] (UT) à Tyler en 1989[1].

Carrière[modifier | modifier le code]

En 1989, Cathy Wu termine sa thèse sur l'utilisation des réseaux neuronaux artificiels pour classer les protéines, et obtient son diplôme. Son directeur de thèse, George M. Witson III, président du département d'informatique de l'UT, l'engagee après l'obtention de son diplôme en 1989. Elle a ensuite enseigné l'informatique en tant que professeure assistant au département d'informatique de l'UT Tyler de 1989 à 1994. Elle a également travaillé comme professeure assistant de 1990 à 1994, professeure associée de 1994 à 1998 et professeure de 1998 à 1999 au département de biomathématiques de l'[[université du Texas à Austin|université du Texas]] Health Center à Tyler. Elle effectue des recherches au collège des sciences de la santé de l'UT Tyler sous la direction du professeure d'épidémiologie et de biomathématiques Jerry McClarty. Elle mène des recherches en bioinformatique à partir de 1990 et développe plusieurs systèmes de classification des protéines et des bases de données. Elle a également géré de grands projets de logiciels et de bases de données en dirigeant l'effort bioinformatique de la Protein Information Resource (PIR) à partir de 1999, et devient directrice de la PIR et vice-présidente de la National Biomedical Research Foundation, Washington, D.C. de 2001 à 2002. De 2001 à aujourd'hui, elle est professeure au département de biochimie et de biologie moléculaire et directrice de PIR au Georgetown University Medical Center (GUMC). Elle est aussi actuellement professeure au département d'oncologie et membre du Lombardi Comprehensive Cancer Center du GUMC depuis 2002. En 2009, Cathy Wu est acceptée comme titulaire de la chaire Edward G. Jefferson de bioinformatique et de biologie computationnelle à l'université du Delaware (UD)[1],[3].

Distinctions accordées[modifier | modifier le code]

  • 2020 - Fellow de l'Association for Computing Machinery (ACM)[4]
  • Juillet 2012 à juin 2017 - 1144726, NSF/DGE, IGERT : Systems Biology of Cells in Engineered Environments (SBE2). Rôle : Co-PI
  • Septembre 2011 à août 2015 - 2R01GM080646-06 & 3R01GM80646-07S1, NIH/NIGMS, PRO : Une ontologie protéique dans les ontologies biomédicales ouvertes. Rôle : PI
  • Juillet 2011 à juin 2015 - 1062520, NSF/DBI, ABI Development : Bioinformatique intégrative pour ldécouvree de connaissances des réseaux PTM. Rôle : PI
  • Septembre 2011 à août 2014 - DOE/FOA-0000368, Approches expérimentales de biologie systémique pour la production de bioénergie à partir de Clostridia. Rôle : Co-PI
  • Novembre 2009 à février 2014 - 8P20GM103446, NIH/NIGMS, Delaware INBRE Rôle : Directeur du noyau bioinformatique
  • Août 2010 à 2013 - 1G08 LM010720-01, NIH/NLM, Linking Text Mining and Data Mining for Biomedical Knowledge Discovery. Rôle : PI
  • Septembre 2010 à juillet 2013 - 1U41HG006104-01, NIH/NHGRI, UniProt : Une ressource centralisée sur la séquence et la fonction des protéines. Rôle : Co-PI
  • De septembre 2009 à août 2012 - DBI-0850319, NSF/DBI, Linking Text Mining with Ontology and Systems Biology. Rôle : PI
  • Juin 2011 à mai 2012 - 1137427, NSF/IIS, III : Small : Women in Bioinformatics Initiative at ACM BCB 2011. Rôle : Co-PI
  • Septembre 2009 à avril 2012 - 3R01GM080646-04S2, NIH/NIGMS, Pro : Une ontologie protéique dans les ontologies biomédicales ouvertes. Rôle : PI[5]

Livres et publications[modifier | modifier le code]

Livres[modifier | modifier le code]

  • Bioinformatics for Comparative Proteomics (Methods in Molecular Biology), , par Cathy H. Wu (éditeur), Chuming Chen (éditeur), (ISBN 978-1607619765)
  • Computational Biology and Genome Informatics, février 2003, par Cathy H. Wu (Auteur), Paul P. Wang (Auteur), Jason T. L. Wang (Editeur), (ISBN 978-9812382573)
  • Neural Networks and Genome Informatics, Volume 1 (Methods in Computational Biology and Biochemistry), , par C.H. Cathy Wu (Rédacteur), J.W. McLarty (Rédacteur), (ISBN 978-0080428000)[1]

Publications[modifier | modifier le code]

  • UniProt : une plaque tournante pour l'information sur les protéines. Consortium UniProt. Nucleic Acids Res. Jan 28;43 (Numéro de base de données) (2015)
  • Suzek, BE ; Wang, Y ; Huang, H ; McGarvey, PB ; Cathy Wu, CH (2014). "UniRef clusters : une alternative complète et évolutive pour améliorer les recherches de similarité de séquence". Bioinformatics. 31 (6) : 926-32. DOI 10.1093/bioinformatics/btu739. PMC 4375400. PMID 25398609.
  • Natale, DA ; Arighi, CN ; Blake, JA ; Bult, CJ ; Christie, KR ; Cowart, J ; D'Eustachio, P ; Diehl, AD ; Drabkin, HJ ; Helfer, O ; Huang, H ; Masci, AM ; Ren, J ; Roberts, NV ; Ross, K ; Ruttenberg, A ; Shamovsky, V ; Smith, B ; Yerramalla, MS ; Zhang, J ; AlJanahi, A ; Çelen, I ; Gan, C ; Lv, M ; Schuster-Lezell, E ; Cathy Wu, CH (2014). "Protein Ontology : un réseau structuré contrôlé d'entités protéiques". Nucleic Acids Res. 42 (numéro de base de données) : D415-21. DOI 10.1093/nar/gkt1173. PMC 3964965. PMID 24270789.
  • Activités à la ressource universelle de protéine (UniProt). Nucleic Acids Res. 42 (numéro de base de données) : D191-8. 2014. DOI 10.1093/nar/gkt1140. PMC 3965022. PMID 24253303[3].

Liens externes[modifier | modifier le code]

  • Ressource d'information sur les protéines
  • Centre de bioinformatique et de biologie computationnelle, Université du Delaware

Notes et références[modifier | modifier le code]

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Cathy H. Wu » (voir la liste des auteurs).
  1. ↑ a b c et d (en) « Center For Bioinformatics & Computational Biology » (consulté le )
  2. ↑ (en) « Cathy Wu at the Crossroads » (consulté le )
  3. ↑ a et b (en) « Protein Information Resource, Cahty H. Cathy Wu, Ph.D. » (consulté le )
  4. ↑ (en) « ACM Fellows », Notices of the American Mathematical Society, vol. 68, {{Article}} : paramètre « date » manquant, p. 832 (lire en ligne)
  5. ↑ (en) « University of Delaware Directory, Cathy Wu, Grant Awards » [archive du ] (consulté le )

Voir aussi[modifier | modifier le code]

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